В 2003 году по инициативе Совета администрации Красноярского края и Законодательного Собрания Красноярского края в целях приведения нормативной базы муниципальных образований в соответствие с требованиями законодательства (Федеральный закон №131-ФЗ «Об общих принципах организации местного самоуправления в Российской Федерации») согласно Постановлению Совета администрации Красноярского края от 04.08.2003 N 227-п (ред. от 03.03.2010) «О создании Красноярского краевого государственного учреждения «Консультационно-методический центр» создано Красноярское краевое государственное учреждения «Консультационно-методический центр».

В период проведения реформы местного самоуправления Учреждение оказывало правовую поддержку и консультационно-методическую помощь органам местного самоуправления.

С 1 января 2009 года Федеральный закон №131-ФЗ «Об общих принципах организации местного самоуправления в Российской Федерации» вступил в полную силу.

В целях содействия эффективной реализации местного самоуправления Постановлением Правительства Красноярского края от 18.12.2008 №243-п Учреждение было переименовано в Красноярское краевое государственное бюджетное учреждение «Красноярский центр муниципального развития» с наделением дополнительными функциями.

Постановлением Правительства Красноярского края от 03.03.2010 N 98-п «О переименовании Красноярского краевого государственного бюджетного учреждения «Красноярский центр муниципального развития» и внесении изменений в Постановления Совета администрации Красноярского края, Постановление Правительства Красноярского края по вопросу регулирования деятельности Красноярского краевого государственного бюджетного учреждения «Красноярский центр муниципального развития» ККГБУ «Красноярский центр муниципального развития» был переименован в «Институт муниципального развития».

Устав Красноярского краевого государственного бюджетного учреждения «Институт муниципального развития»